Els avantatges de l'electroforesi en gel de poliacrilamida (PAGE) inclouen principalment els aspectes següents:
Petit efecte electroosmòtic : el gel de poliacrilamida és una substància sintètica amb un petit efecte electroosmòtic i no és fàcil d'interaccionar amb la mostra, cosa que ajuda a reduir la deformació i la difusió de la mostra durant l'electroforesi.
Mida de porus ajustable : la concentració de monòmers es pot ajustar abans de la polimerització per formar diferents graus d'-estructures entrecreuades, canviant així la porositat del gel. Aquesta flexibilitat permet al gel de poliacrilamida seleccionar components de gel adequats segons la mida molecular de la substància a separar, cosa que no només garanteix l'efecte de separació, sinó que també té bones propietats mecàniques.
Estabilitat tèrmica : dins d'un determinat rang de concentració, el gel de poliacrilamida és tèrmicament estable i el gel és incolor i transparent, fàcil d'observar i detectar.
Bon efecte de separació : el gel de poliacrilamida té una mida de porus petita i és especialment adequat per separar fragments d'ADN o ARN polinucleòtids grans i proteïnes més petites. Aquesta característica li permet un bon rendiment en la separació de mostres complexes i millora la resolució de l'electroforesi.
Menys contaminació: l'acrilamida és un compost relativament pur i es pot refinar per reduir la contaminació, cosa que ajuda a mantenir la precisió dels resultats experimentals.